Los orígenes del chihuahua son inciertos.
Hay diferentes teorias, una de ellas es que el perro de raza chihuahua es de origen chino y que fueron los chinos los que lo llevaron a Mexico. Otra teoría, es que desciende de una antigua raza Egipcia, llamada techichi.
En lo que hoy sería el Estado de Chihuahua, Mexico, vivían los Toltecas, quienes habían domesticado unos perros a los que llamaban techichi. Hay tallas de estos perros en el monasterio de Huejotzingo, en la carretera de Mexico a Puebla, que denotan que sus rasgos físicos son muy similares a los del perro chihuahua actual, por lo que se puede inferir que éste desciende de aquellos.

Hay más teorías, pero no están comprobadas, otras son imposibles, algunas son meras leyendas...

Por otro lado, se han encontrado restos de perros pequeños en antiguas tumbas de la civilización Tolteca, lo que corrobora el origen mexicano del chihuahua.

Los inicios de la raza chihuahua se ven reflejados en varios grabados de las culturas mesoamericanas de todas las latitudes de México, incluyendo a los pueblos Tolteca, Azteca, Teotihuacano y Maya.

A falta de fuentes fidedignas, aceptamos la hipótesis que sostiene el origen mexicano del chihuahua, ya que la Federacion Cinológica Internacional, atribuye a México la paternidad de esta raza.
 

El chihuahueño o chihuahua recibe su nombre por Chihuahua (estado del país de México), que fue el lugar donde fue descubierto y domesticado. "Chihuahua" significa "lugar arido y "arenoso". Aunque la raza es conocida popularmente como chihuahua, el nombre oficial de la raza es chihuahueño, chihuahua es el nombre adoptado por los Estados Unidos de America para la raza, debido a que por cuestiones fonéticas de la lengua inglesa no existe el fonema "ñ". Los chihuahuas fueron llevados a Estados Unidos por visitantes norteamericanos que visitaban el Norte de México y que quedaron cautivados por estos pequeños perros y los presentaron en ferias y exposiciones canófilas donde fue dado a conocer a nivel mundial.

El perro de raza chihuahua fue reconocido oficialmente por el AKC en 1904.

El primer chihuahua registrado se llamaba Midget que significa enano.